在HSCT领域关注肠道微生态包括：肠道微生物在HSCT中的变化、肠道微生物变化与HSCT并发症的关系、肠道微生物变化与HSCT后复发的关系、FMT在HSCT中的应用等方面。目前在探索HSCT过程中肠道微生物的变化，以及它对移植相关并发症发病机制的影响和与移植结果的关联。HSCT的建立通过各种机制可能对肠道微生物平衡造成了破坏，例如广谱抗生素的使用、饮食改变(限制)、预处理方案对肠道上皮的损伤和供体免疫系统的引入。来自临床研究的数据支持肠道微生物的改变，主要是在同种HSCT后肠道多样性的丧失和组成的变化，与患者结局如aGVHD相关，与死亡率、非复发死亡率(NRM)和总体生存(OS)的相关联。肠道微生物结构变化与肠道GVHD的关系研究层出不穷，目前倾向的是GVHD与特定的菌群生态失调有关。

FMT目的是重建肠道微生态平衡、修复肠粘膜屏障，控制炎症反应，调节机体免疫，进而治疗特定肠道内外疾病。

FMT治疗肠道及相关疾病，最早来源于消化系统疾病的探索，近十年来FMT在HSCT领域治疗移植后肠道GVHD及菌群失调取得了较快的研究和发展。2014年BLOOD上发表的研究论著显示异基因HSCT后肠菌多样降低的相关因素有：较强的预处理，急性肾损伤，接受广谱抗生素治疗，艰难梭菌感染等。肠菌多样性低级别其总生存率显著降低（P=0.019)，移植相关死亡率显著升高（P=0.003）。2016年BLOOD上发表的一篇FMT治疗激素耐药/激素依赖难治性肠道GVHD临床研究，4例患者中3例得到缓解，1例有效。FMT治疗后Tregs增多，eTreg/CD8+细胞比例增高，FoxP3+CD4+ T增高，与FMT控制GVHD有效相关。

FMT直接改变宿主的肠道微生物群组成，以恢复真生物和肠道稳态，被称为“终极益生菌”，FMT在HSCT后GVHD当中的应用也取得了较满意的临床疗效，目前发表的文章越来越多。粪菌胶囊的制备相对不难，临床应用也越来越广泛，主要包括预防性应用以减少肠道微生态的破坏、治疗性应用包括移植后合并肠道GVHD、肠道菌群紊乱等。

河南省肿瘤医院移植中心自2017.12-至今开展FMT共治疗15例异基因移植后肠道并发症，其中14例合并重度肠道GVHD，一例合并肠道菌群失调。15例中7例粪菌治疗后均获得完全缓解，4例有效，4例无效。

总之，异基因移植后肠道微生态越来越受到关注，FMT在HSCT领域的探索和应用逐渐增多，可能成为肠道GVHD、肠道菌群失调及肠道其他合并症安全有效的治疗方法，其基础方面的作用机制有待进一步研究。