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柳叶刀呼吸医学丨南京医科大学团队利用GWAS多基因评分预测中国人群肺癌风险

作者:肿瘤瞭望   日期:2019/7/19 10:43:12  浏览量:940

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导读:2019年7月17日,柳叶刀旗下子刊《柳叶刀呼吸医学》(The Lancet Respiratory Medicine,IF=22.992)在线发表了我国南京医科大学团队的一项研究首次证明,GWAS衍生的多基因风险评分(PRS)可有效地用于鉴别肺癌高危亚群,这些亚群可能受益于基于PRS的中国人群肺癌精确预防筛查方案。

遗传变异在非小细胞肺癌(NSCLC)的发生发展中具有重要作用。然而,肺癌的遗传因素尚未完全确定,特别是在中国人群中,这限制了使用现有的多基因风险评分(polygenic risk scores,PRS)来确定肺癌高危亚群以预防肺癌。因此,本研究旨在鉴定与NSCLC风险相关的新基因座,并产生一个PRS,评估其在中国人群肺癌风险预测中的效用和效力。

为了系统地识别NSCLC风险的基因变异,研究者对南京医科大学全球筛查阵列项目的中国NSCLC病例和对照组中的19 546个样本进行了新的基因分型,并对27 120个NSCLC病例和27 355个没有罹患NSCLC(中国人后裔:13 327个病例和13 328个对照;欧洲人后裔:13 793个病例和14 027例对照)的样本进行了全基因组关联研究的荟萃分析(GWASs)。随后研究者根据所有报道的单核苷酸多态性为中国人群建立了一个PRS,这些多态性在全基因组显著性水平上与肺癌风险相关。研究者进一步在中国嘉道理生物银行(China Kadoorie Biobank,CKB)95 408名患者的独立前瞻性队列中,通过10年以上的随访,评估了该PRS在预测肺癌高风险亚群方面的效用和效力。
 
该研究确定了19个(p≤5.0×10-8时)与NSCLC风险显著相关的易感性位点,包括6个新的位点。当应用于CKB队列时,相较于低遗传风险参与者(后10%),风险位点的PRS成功地以剂量反应的方式预测了高遗传风险参与者(前10%)的肺癌发病事件(调整后的风险比1.96,95%可信区间1.53-2.51;P趋势=2.02×10−9)。尤其是观察到低、中、高基因风险个体肺癌事件的连续分离曲线,且PRS是年龄和烟龄以外的独立有效风险分层指标。
 
原文链接:
Juncheng Dai,Prof Jun Lv, Meng Zhu, et al.Identification of risk loci and a polygenic risk score for lung cancer: a large-scale prospective cohort study in Chinese populations.Lancet Respir Med;Published:July 17, 2019DOI:https://doi.org/10.1016/S2213-2600(19)30144-4
 

版面编辑:洪山  责任编辑:彭伟彬


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